Este templo fue construido poco después de la creación de la parroquia de S. Simão do Nesperal (siglo XVI) por parte de sus vecinos.

La Iglesia tenía cuatro altares, donde se encontraban las imágenes de S. Simão, Nossa Sr.ª. da Soledade, S. Brás, Santo António, Espírito Santo, Nª Sr. ª da Piedade, Nª Sr. ª do Rosário y S. Miguel.

En 1787 hubo obras en el techo y la torre del reloj. Sin embargo, en 1824, la población de Nesperal pidió al Gran Priorato de Crato «reparar y reconstruir» su iglesia madre, «que se encuentra en el más deplorable estado de ruina, y próxima a ser demolida por completo, por la falta de carpintería y reparaciones, que está muy necesitada». La intervención avanzó al año siguiente.

La iglesia posee un admirable predio donde destacan tres tablas del pintor Gonçalo Prego, con marcos de talla epimaneirista y dorada, que representan, respectivamente, a S. João Batista, Agnus Dei y D. Nuno Álvares Pereira, que datan del siglo XVII. La imagen de D. Nuno Álvares Pereira sigue, según los autores Vítor Serrão y Ana Maria Farinha, el estilo del retrato aristocrático. Retablos barrocos de Estilo Nacional jalonan el altar mayor, donde también hay una imagen de Cristo en la Cruz y esculturas de S. Miguel, la Santísima Trinidad (en piedra caliza y originarias del siglo XV), Nossa Senhora da Piedade y São Brás (pieza gótica tardía). También se hace referencia a la existencia de una pila bautismal en piedra de granito con la cruz de la Orden de Cristo grabada en el frontal (posiblemente del siglo XIV), así como diferentes objetos de orfebrería y marfil.

Ha sido objeto de obras en los últimos años.

En 1700, el Gran Prior de Crato financió la reconstrucción de la capilla mayor (ya había sido intervenida en 1630) y de la sacristía. También en ese año, las cofradías «mandaron hacer las molduras y paneles para el techo del presbiterio y los dos altares laterales, por lo que gastaron 110.000 réis».